小苗出现黑根死亡的原因可能有以下几个方面：

1. 过浇水：过度浇水是导致小苗黑根死亡的常见原因之一。如果土壤过于湿润，根部可能会受到氧气不足和腐烂的影响，导致黑根死亡。

2. 缺氧：土壤缺氧也是引起小苗黑根死亡的原因之一。土壤中的氧气对于植物根系的正常生长至关重要。过于密实或过于湿润的土壤会限制氧气进入根部，导致根部窒息和死亡。

3. 病菌感染：一些真菌、细菌或病毒感染可能导致根部的疾病，进而导致黑根死亡。这些病菌可能通过土壤或受伤的根部侵入，并在根系内部繁殖，破坏根部组织。

4. 高温或低温胁迫：极端温度条件（高温或低温）可能导致小苗的根部受损，造成黑根死亡。高温会烫伤根部，导致组织坏死；而低温则可能引起冻害或冻伤。

5. 营养不良：缺乏必要的营养元素，如氮、磷、钾等，会影响小苗的根系生长和发育。根部无法获得足够的养分供应，导致黑根死亡。

为了避免小苗黑根死亡，可以采取以下措施：

- 控制浇水量，避免过度浇水。

- 提供适当的通风和排水条件，以保证土壤中有足够的氧气供应。

- 防止病菌感染，可使用合适的杀菌剂进行治疗或选择抗病性较强的品种。

- 注意栽培环境的温度调节，避免极端的温度胁迫。

- 确保提供充足的营养，根据植物的需求进行适当的施肥。

如果小苗出现黑根死亡，建议检查以上因素并适时采取措施进行修复。如果问题持续存在，最好咨询专业园艺师或植物病理学家的建议。